導讀 | 第七屆國際基因產業大會于2016年11月3-5日在上海外高橋喜來登酒店召開。從11月3日下午到4日和5日,國際基因產業大會以不同議題組織分會場進行學術報告和交流討論。今天小編就給您分享一下大會的基因組藥物和個性化醫療當前趨勢的專場報告,聊一聊在精準醫療方面各國都做的怎么樣了。 |
第七屆國際基因產業大會于2016年11月3-5日在上海外高橋喜來登酒店召開。此次會議邀請了自世界40多個國家和地區在基因領域最具影響力的世界著名大學與研究機構的專家,世界各大基因產業公司高管、資深科學家和項目組長。
從11月3日下午到4日和5日,國際基因產業大會以DNA和RNA的研究,基因組學和遺傳學的進步,生命科學的前沿研究,醫學應用的新興領域,生物催化和生物工藝,強大的技術開發和應用的基因技術在農業和食品領域等不同議題組織分會場進行學術報告和交流討論。今天小編就給您分享一下大會的基因組藥物和個性化醫療當前趨勢的專場報告,聊一聊在精準醫療方面各國都做的怎么樣了。
梅奧醫學中心Richard Weinshilboum教授報告
已在開幕式做過大會特邀嘉賓報告的美國臨床藥理學委員會提名委員會主席,美國著名梅奧醫學中心的教授Richard Weinshilboum醫生在這個專題內又做了報告,介紹了梅奧中心在個性化醫療方面所做的工作。在個性化醫療的研究范疇,梅奧醫學中心除了前面提到的藥物基因組學,在進行中的計劃還包括生物標志物的發現、臨床多組學研究、表觀基因組學和微生物菌群基因組學。梅奧的藥物基因組學和精準醫療研究由NIH的藥物基因組研究網絡(PGRN)基金和eMERGE基金支持。
他詳細介紹了前面提到的梅奧 RIGHT 10K 計劃,這個計劃將在梅奧的患者中分析上萬人的藥物基因組,將數據結合電子醫療記錄進行分析。在梅奧患者的1萬人生物數據庫中抽取77名進行二代基因測序,將電子醫療記錄溯源至20年前,醫療記錄警示了存在19對藥物和基因的配對。計劃的研究既運用醫療記錄進行回顧性分析,來避免由于藥物基因型的存在造成的藥物無效的作用;也用基因與藥物的數據分析進行預測研究避免缺乏藥效的分析。
在癌癥基因組分析方面的研究,他們既進行生殖細胞基因組分析也進行癌癥體細胞基因組分析,該項研究稱為Germline-Somatic Genome PGx Cross-Talk。Richard Weinshilboum醫生舉了他們在乳腺癌方面進行精準醫療的例子,研究項目開展之前,乳腺癌在梅奧就是按基因型來內分泌療法和化療的。新的項目在乳腺癌HER2+中的診斷、藥物治療和手術中每一步都綜合影像、生物分析和基因組測序。這個治療叫做乳腺癌基因組介導的治療,縮寫為BEAUTY。從2012年對第一個病人實施,2014年增加為140名,現在已經進入了第二期,對所有的乳腺癌病人都根據DNA進行個性化治療。
梅奧醫學中心 Liewei Wang教授則詳細介紹了在他們在BEAUTY計劃中,將人源性腫瘤組織異種移植模型運用在乳腺癌藥物基因組中的研究與治療。之所以要用活檢組織和病人樣本制備人源性腫瘤組織異種移植模型,是由于患者對于化療的反應很不一致,治療也沒有明顯的生物標志物。
傳統的模式是對腫瘤手術后化療觀察,而新的輔助療法是對腫瘤活檢取樣后移植到小鼠,然后對模型進行組織化學和微芯片分析,進行藥物基因組學的外顯子、RNA、表觀基因組和蛋白組的多組學分析,根據這些結果進行藥物篩選。再根據化療藥物處理的結果來進行手術和用藥。新的輔助療法允許在短時間內研究藥物的反應,獲得不同基因組的化療結果,并構建體內模型。這個模型允許對于藥物抗性的腫瘤檢測不同的療法的作用,并研究不同患者間遺傳改變后的功能變化。此模型運用在高風險的乳腺癌病人里獲得了長期的生存。
她總結說藥物基因組模型將會很快地發展并成為預臨床藥物研發的標準工具。整合的多組學也將幫助我們理解藥物抗性的機制,加快藥物的研發。
來自于加拿大阿爾伯特大學Katherine J Aitchison教授介紹了基因組學在臨床上的應用。她一CYP2D6基因為例介紹了他們在藥物基因組上的工作。CYP2D6是最廣泛被描述的藥物代謝多組學的酶,有20-25%的藥物由這個酶代謝,對于臨床用藥非常重要。有些藥物和抗生素往往由CYP2D6代謝或者是它的抑制劑,或兩者都是。而CYP2D6的分布在個體間有很大差異。
Katherine J Aitchison教授介紹CYP2D6有四種不同的基因型:UM,EM,IM和PM,它們的分布在不同種族中是不相同的。已經發現了100種以上的等位基因。根據他們的研究CYP2D6可能的臨床測試平臺使用Affymetrix的芯片。在這三種基因型中安定藥的使用可以區分出不同的劑量,讓精神疾病的治療更加有效。
加拿大麥克馬斯特大學Judah A. Benburg教授則介紹了過敏和哮喘方面的精準治療和生物標志物的研究。AllerGen研究過敏、基因和環境的關系,由1989年開始的加拿大杰出中心網絡計劃所支持,旨在產生一個持久的機制來減輕過敏和其它相關疾病的影響。到2019年的AllerGen包含三個部分:加拿大新生兒長期發育研究,臨床調查的合作以及國家食物過敏研究方案。將對過敏相關的生物標志物和生物信息學,基因-環境的作用以及病人、政策和公共衛生進行研究。
關于項目的進展情況,Judah A. Benburg教授介紹了他們在加拿大新生兒長期發育研究計劃中,調查了出生百日內減少過敏風險的細菌。這是第一篇將微生物菌群和過敏聯系起來的研究文章,能夠鑒定有過敏風險的孩童并進行治療。在這個計劃的范疇中他們還調查了戶外空氣污染的影響,鑒定了對已有環境的精準評估并篩選出能作為生物標志物的腸道菌。
其中AirSENCE個人空氣暴露過敏原分析計劃是與北京大學合作的,由兩國間的研究計劃和企業合作伙伴提供支持。此項目能夠提供對戶外或戶內污染的個人評估和管理。